Alrededor de la cirugía peneana existe grandes controversias referidas a los riesgos que se asumen. Muchos de los resultados de la cirugía peneana únicamente son visibles en reposo, es decir, con el pene en estado flácido, ya que en erección, el tamaño del miembro no se incrementará porque el tamaño del pene en erección no depende de su tamaño en flacidez.
Para tratar este problema de pene pequeño o micropene, se utiliza la cirugía peneana de alargamiento del pene, también conocida como la faloplastia o la penoplastia que consiste en un aumento del grosor y un alargamiento del tamaño del pene. Esta intervención quirúrgica no es un tratamiento para curar la impotencia, y tampoco permite mejorar tus capacidades sexuales.